차세대염기서열분석(NGS)을 이용한 식물 바이러스 진단이 기존 RT-PCR 진단에 비해 갖 상세 페이지
1[식물보호기사 필기] 23년 1회차
차세대염기서열분석(NGS)을 이용한 식물 바이러스 진단이 기존 RT-PCR 진단에 비해 갖는 가장 큰 장점은?
1
시료에서 핵산을 추출하지 않고 조직을 그대로 넣어 분석할 수 있다
2
살아 있는 병원체만 선택적으로 검출하므로 사멸한 병원체는 검출되지 않는다
3
항혈청을 이용하므로 진단에 드는 비용이 가장 저렴하다
4
병원체의 염기서열 정보를 미리 알지 못해도 시료에 들어 있는 바이러스를 한 번에 검출하고 동정할 수 있다
해설
RT-PCR은 검출하려는 바이러스의 염기서열을 미리 알고 그에 맞는 특이 프라이머를 설계해야 하므로, 표적으로 삼지 않은 바이러스나 신종은 놓친다. 반면 차세대염기서열분석(NGS)은 시료의 핵산 전체를 무작위로 해독한 뒤 데이터베이스와 대조하므로, 사전 서열정보 없이도 시료에 들어 있는 여러 바이러스를 한 번에 검출하고 동정할 수 있다. 다만 핵산 추출은 여전히 필요하고, 사멸한 병원체의 핵산도 검출되며 비용은 오히려 높다.
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