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밤나무 줄기마름병균은 병반 위에 만들어진 자낭포자가 주로 바람을 타고 날아가 새로운 나무의 상처 부위로 옮겨진다.
이 병은 상처를 통해 침입해 줄기와 가지의 형성층을 죽이며, 분생포자는 비바람에 씻겨 흐르거나 곤충·조류에 묻어 이동하지만, 병을 널리 퍼뜨리는 주된 전반 경로는 공기 중으로 비산하는 포자다.
토양·종자: 이 병균은 토양이나 종자에 잠복해 전염되는 유형이 아니다.
선충: 선충이 매개하는 소나무재선충병과도 전반 방식이 다르다.
따라서 방제는 상처를 만들지 않고 발생한 병든 가지를 제거·소각하는 것이 핵심이다.