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자료흐름도와 데이터베이스 내용을 다루는 단계가 논리적 설계, 서버 모델·소프트웨어·통신장비 사양·백업 시스템을 다루는 단계가 물리적 설계다.
논리적 설계는 시스템이 무엇을 어떤 흐름으로 처리하는가를 기술한다. 자료흐름도(DFD)로 데이터의 이동과 처리 과정을 나타내고, 사이트에서 사용할 데이터베이스의 구조와 항목을 정의하는 작업이 여기에 속한다.
물리적 설계는 그 논리를 어떤 장비 위에서 구현할 것인가를 정한다. 서버 기종과 소프트웨어, 통신장비 사양, 백업 체계처럼 실제 구축과 운영에 필요한 하드웨어·인프라 결정이 이 단계의 산출물이다.
개념적 설계는 설계의 가장 앞 단계로 업무 요구사항을 개체와 관계 수준으로 추상화하는 작업이어서, 자료흐름도나 장비 사양을 담는 두 괄호 어디에도 들어가지 않는다.